Другое

Как исправить ошибку 'non-numeric matrix extent' в R: Полное руководство

Узнайте, как устранить ошибку 'non-numeric matrix extent' в R при создании матриц. Узнайте о распространенных причинах, пошаговых решениях и стратегиях предотвращения для надежного кода на R.

Я сталкиваюсь с ошибкой при попытке создать матрицы в R для хранения векторов разницы средних ковариат для симуляций. Вот мой код:

r
# Хранилище: для каждой симуляции мы храним вектор разницы средних ковариат (длины p1 или p2)

diffs_pure_t1 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1)

diffs_rerand_t1 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1)

diffs_pure_t2 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p2)

diffs_rerand_t2 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p2)

Сообщение об ошибке, которое я получаю:

Error in matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1) : non-numeric matrix extent

Как можно исправить ошибку “нечисловые размеры матрицы” при создании матриц в R?

Ошибка “non-numeric matrix extent” в R возникает, когда параметры nrow или ncol в вашей функции matrix() не являются числовыми значениями. Это обычно происходит, когда переменные, такие как Nsim, p1 или p2, хранятся как символьные строки, факторы, списки или другие нечисловые типы данных вместо правильных числовых значений. Чтобы решить эту проблему, вам нужно убедиться, что эти переменные правильно определены как числовые перед созданием матриц.

Содержание

Понимание сообщения об ошибке

Ошибка “non-numeric matrix extent” в R является одним из самых понятных сообщений об ошибках. Когда вы вызываете matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1), R ожидает, что как nrow, так и ncol будут числовыми значениями, определяющими размеры вашей матрицы. Если любой из этих параметров не является числовым, R выдает эту конкретную ошибку.

Ключевое замечание: Ошибка не указывает на проблему со значениями NA или вашей структурой данных - она касается именно нечисловых размеров.

Распространенные сценарии, в которых появляется эта ошибка:

r
# Эти вызовы вызовут ошибку:
matrix(1, nrow = "foo", ncol = 1)      # Символьная строка
matrix(1, nrow = factor(5), ncol = 1)  # Фактор
matrix(1, nrow = list(1), ncol = 1)    # Список

Распространенные причины ошибки

На основе результатов исследования, вот наиболее распространенные причины ошибки “non-numeric matrix extent” в вашем конкретном контексте:

1. Неправильное присвоение переменных

Переменные Nsim, p1 или p2 могут существовать, но не содержать числовых значений:

r
# Это вызовет ошибку, если Nsim был определен как:
Nsim <- "100"  # Символ вместо числа
Nsim <- factor(100)  # Фактор вместо числа
Nsim <- list(100)    # Список вместо числа

2. Проблемы с преобразованием типов данных

При импорте данных из внешних источников (CSV-файлы, базы данных и т.д.) числовые столбцы могут считаться как символьные строки или факторы:

r
# Таблица данных с импортированным p1 как символьный
my_data <- data.frame(p1 = c("5", "6", "7"))
p1 <- my_data$p1  # Это будет символьный, а не числовой

3. Математические операции, приводящие к нечисловым значениям

Если ваши переменные вычисляются через операции, которые могут завершиться с ошибкой:

r
# Если p1 был вычислен как:
p1 <- nchar("some_text")  # Это возвращает число, но другие операции могут не работать

4. Конфликты переменных в окружении

Иногда переменные могут быть случайно перезаписаны или переопределены:

r
# Позже в вашем скрипте вы могли случайно сделать:
p1 <- "5"  # Перезаписано символьным значением

Пошаговые решения

Решение 1: Проверка типов переменных

Сначала проверьте типы ваших переменных с помощью str() или class():

r
# Проверьте структуру всех соответствующих переменных
str(Nsim)
str(p1) 
str(p2)

# Или проверьте классы специально
class(Nsim)
class(p1)
class(p2)

Решение 2: Преобразование переменных в числовые

Если ваши переменные не являются числовыми, преобразуйте их с помощью as.numeric():

r
# Преобразуйте в числовые, если они еще не являются таковыми
Nsim <- as.numeric(Nsim)
p1 <- as.numeric(p1)
p2 <- as.numeric(p2)

# Теперь создание вашей матрицы должно работать
diffs_pure_t1 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1)
diffs_rerand_t1 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1)
diffs_pure_t2 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p2)
diffs_rerand_t2 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p2)

Решение 3: Правильная работа с факторами

Если ваши переменные являются факторами, сначала преобразуйте их в числовые:

r
# Для факторов может потребоваться преобразование через символьный тип сначала
if (is.factor(p1)) {
  p1 <- as.numeric(as.character(p1))
}

Решение 4: Валидация перед созданием матрицы

Добавьте проверки валидации, чтобы убедиться, что ваши переменные являются числовыми:

r
# Проверьте переменные перед созданием матрицы
if (!is.numeric(Nsim)) {
  stop("Nsim должен быть числовым")
}
if (!is.numeric(p1)) {
  stop("p1 должен быть числовым")
}
if (!is.numeric(p2)) {
  stop("p2 должен быть числовым")
}

# Теперь безопасно создавайте матрицы
diffs_pure_t1 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1)

Стратегии предотвращения

1. Явное присвоение переменных

Всегда явно присваивайте числовые значения с правильным типом:

r
# Хорошая практика
Nsim <- 100L  # Целое число
p1 <- 5L      # Целое число  
p2 <- 3L      # Целое число

2. Использование suppressWarnings() для импортируемых данных

При импорте данных убедитесь в правильном преобразовании типов:

r
# При чтении данных укажите типы столбцов
data <- read.csv("your_data.csv", colClasses = c("numeric", "numeric", "numeric"))

3. Добавление обработки ошибок

Оберните создание матрицы в обработку ошибок:

r
tryCatch({
  diffs_pure_t1 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1)
  diffs_rerand_t1 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1)
  diffs_pure_t2 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p2)
  diffs_rerand_t2 <- matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p2)
}, error = function(e) {
  message("Ошибка при создании матриц: ", e$message)
  message("Типы переменных: Nsim=", class(Nsim), ", p1=", class(p1), ", p2=", class(p2))
})

Расширенное устранение неполадок

Если базовые решения не работают, попробуйте эти продвинутые подходы:

1. Отладка присвоения переменных

Отследите, где ваши переменные присваиваются:

r
# Используйте browser() для пошагового выполнения кода
debug({
  # Ваш код присваивания переменных здесь
  Nsim <- 100
  p1 <- 5
})

2. Проверка на скрытые символы или пробелы

r
# Удалите любые скрытые пробелы или непечатаемые символы
Nsim <- gsub("\\s", "", as.character(Nsim))
p1 <- gsub("\\s", "", as.character(p1))
p2 <- gsub("\\s", "", as.character(p2))

# Преобразуйте в числовые
Nsim <- as.numeric(Nsim)
p1 <- as.numeric(p1)
p2 <- as.numeric(p2)

3. Использование dput() для проверки содержимого переменных

r
# Посмотрите точно, что содержат ваши переменные
dput(Nsim)
dput(p1)
dput(p2)

Тестирование вашего решения

После реализации решения тщательно его протестируйте:

r
# Протестируйте с известными значениями
Nsim <- 100
p1 <- 5
p2 <- 3

# Создайте тестовые матрицы
test_matrices <- list(
  diffs_pure_t1 = matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1),
  diffs_rerand_t1 = matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p1),
  diffs_pure_t2 = matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p2),
  diffs_rerand_t2 = matrix(NA, nrow = Nsim, ncol = p2)
)

# Убедитесь, что все матрицы были созданы успешно
all(sapply(test_matrices, function(mat) !inherits(mat, "try-error")))

Источники

  1. Stack Overflow - How to counter the ‘non-numeric matrix extent’ error in R?
  2. ResearchGate - How to overcome the “non-numeric matrix extent” error
  3. CopyProgramming - Resolving the ‘non-numeric matrix extent’ error in R
  4. GeeksforGeeks - How to Fix matrix Error in R
  5. Stack Overflow - Handling non-numeric values in matrix

Заключение

Ошибка “non-numeric matrix extent” обычно легко решается, как только вы понимаете ее коренную причину. Вот основные выводы:

  1. Всегда проверяйте типы переменных перед использованием их в создании матрицы с помощью str() или class()
  2. Преобразуйте в числовые с помощью as.numeric(), если переменные хранятся как символьные строки, факторы или другие типы
  3. Добавляйте проверки валидации для раннего обнаружения проблем с типами в вашем коде
  4. Внимательно обрабатывайте импортируемые данные, указывая правильные типы столбцов при импорте данных
  5. Используйте защитное программирование с tryCatch() для предоставления информативных сообщений об ошибках

Реализуя эти практики, вы предотвратите эту ошибку и создадите более надежный код на R, который корректно обрабатывает различные типы данных. Помните, что эта ошибка - это способ R сообщить вам, что размеры матрицы должны быть числовыми - на самом деле это помогает вам обнаружить потенциальные ошибки на ранних этапах вашего аналитического конвейера.

Авторы
Проверено модерацией
Модерация