Полное руководство по даунскейлингу палеоклиматических данных PMIP
Изучите Python-воркфлоу для даунскейлинга низкоразрешенных палеоклиматических данных PMIP с ESGF. Узнайте статистические и динамические подходы для даунскейлинга MPI-ESM1-2-LR с разрешения 250 км до разрешения 10-50 км с использованием репозиториев PyESD, scikit-downscale и DeepDownscaling.
Понижение разрешения выходных данных палеоклиматических моделей PMIP
Не знает ли кто-нибудь о репозитории на GitHub или имеет рабочий процесс для понижения разрешения данных палеоклимата с низким разрешением от Федерации сетей земных систем (Earth System Grid Federation) с использованием Python? Я открыт как к статистическим, так и к динамическим подходам. В качестве примера, я хочу понизить разрешение модели земной системы MPI-ESM1-2-LR, которая в настоящее время имеет разрешение 250 км, до идеального разрешения 10-50 км.
Несколько репозиториев GitHub и рабочих процессов на Python доступны для понижения разрешения низкоразрешенных данных палеоклимата от Федерации сетей данных Земной системы (Earth System Grid Federation), особенно для статистических подходов, применяемых к моделям, таким как MPI-ESM1-2-LR. Как статистические, так и методы глубокого обучения могут эффективно понижать разрешение данных MPI-ESM1-2-LR с 250 км до целевого диапазона 10-50 км, при этом такие фреймворки, как PyESD, scikit-downscale и DeepDownscaling, предлагают комплексные решения.
Содержание
- Обзор PMIP и MPI-ESM1-2-LR
- Статистические методы понижения разрешения
- Динамические методы понижения разрешения
- Рабочие процессы Python и репозитории GitHub
- Шаги реализации
- Доступ к данным из ESGF
Обзор PMIP и MPI-ESM1-2-LR
Проект сравнения моделей палеоклимата (PMIP) координирует исследования прошлых состояний климата с использованием моделей земной системы. В вашем конкретном случае особенно релевантна модель MPI-ESM1-2-LR из Института метеорологии им. Макса Планка. Эта конфигурация с низким разрешением имеет атмосферное горизонтальное разрешение, ограниченное T63, что соответствует примерно размеру ячейки сетки 200 км [источник]. Хотя вы упоминали 250 км, фактическое разрешение ближе к 200 км, что все еще значительно грубее, чем ваше целевое разрешение 10-50 км.
Выходные данные модели MPI-ESM1-2-LR доступны через наборы данных проекта сравнения связанных моделей фазы 6 (CMIP6) в рамках деятельности PMIP, что делает их доступными через портал данных Федерации сетей данных Земной системы (ESGF) [источник]. Эта модель включает как исправления кода, так и улучшения параметризации, что делает ее подходящей для приложений по понижению разрешения палеоклимата [источник].
Статистические методы понижения разрешения
Статистическое понижение разрешения устанавливает статистические зависимости между крупномасштабными переменными климата (предикторами) и локальными переменными климата (предиктандами) для преобразования выходных данных модели с грубым разрешением в более высокое разрешение. Для приложений в области палеоклимата доступно несколько статистических фреймворков на Python:
Эмпирическое статистическое понижение разрешения (ESD)
Пакет PyESD выделяется как комплексный фреймворк на Python, специально разработанный для эмпирическо-статистического понижения разрешения климатической информации [источник]. Этот пакет может понижать разрешение любых климатических переменных (например, осадков и температуры) с использованием предикторов из наборов данных повторного анализа, таких как ERA5, до точечного масштаба. PyESD использует множество алгоритмов машинного обучения и искусственного обучения в качестве передаточной функции, что делает его особенно подходящим для данных палеоклимата [источник].
Подходы на основе машинного обучения и глубокого обучения
Несколько репозиториев используют современные методы машинного обучения для понижения разрешения климата:
- DeepDownscaling от SantanderMetGroup предоставляет подходы на основе глубокого обучения, специально разработанные для статистического понижения разрешения в климатической науке [источник]
- scikit-downscale предлагает статистическое понижение разрешения климата на Python с вкладами сообщества Pangeo [источник]
- Репозиторий project-cchain-climate-downscaling сосредоточен на открытых моделях понижения разрешения климата на основе глубокого обучения, которые особенно ценны для районов с недостатком данных [источник]
Эти подходы отлично подходят для захвата нелинейных зависимостей в данных палеоклимата и могут эффективно достигать вашего целевого разрешения 10-50 км.
Динамические методы понижения разрешения
Динамическое понижение разрешения использует физические уравнения, моделирующие крупномасштабные атмосферные системы, для аппроксимации более высокого разрешения [источник]. Хотя оно менее часто реализуется в рабочих процессах Python для приложений в области палеоклимата, оно предоставляет альтернативный статистический подход, который может быть ценным для определенных приложений.
В отличие от статистических методов, которые опираются на исторические зависимости, динамическое понижение разрешения решает примитивные уравнения атмосферного движения в более высоком разрешении, включая больше физических процессов. Этот подход может быть вычислительно интенсивным, но может захватывать локальные особенности, которые статистические методы могут упустить в реконструкциях палеоклимата.
Рабочие процессы Python и репозитории GitHub
Несколько комплексных репозиториев GitHub предоставляют готовые к использованию рабочие процессы для понижения разрешения данных палеоклимата:
PyESD (Dan-Boat/PyESD)
Это, пожалуй, наиболее релевантный репозиторий для ваших нужд. PyESD специально разработан для эмпирическо-статистического понижения разрешения и находится в активной разработке [источник]. Пакет включает:
- Демонстрация рабочего процесса: Для использования модели PP-ESD для понижения разрешения данных климатической модели, метеорологических станций и наборов данных повторного анализа требуются. Предикторы загружаются в виде файлов netCDF, а предиктанд - в виде файла csv [источник].
- Интеграция машинного обучения: Использует различные алгоритмы машинного обучения и искусственного обучения в качестве передаточных функций
- Активное сообщество: Все соавторы приветствуются, что указывает на постоянную разработку и поддержку
scikit-downscale (pangeo-data/scikit-downscale)
Этот репозиторий предоставляет инструменты статистического понижения разрешения климата на Python, разработанные в экосистеме Pangeo [источник]. Ключевые особенности включают:
- Интеграцию с другими инструментами Pangeo для обработки данных
- Статистические методы для понижения разрешения климатических переменных
- Поддержку обработки больших наборов данных, типичных для моделей палеоклимата
DeepDownscaling (SantanderMetGroup)
Этот репозиторий сосредоточен на подходах на основе глубокого обучения для статистического понижения разрешения в климате [источник]. Он включает:
- Ноутбуки Jupyter с проработанными примерами
- Интеграцию с основными пакетами climate4R
- DownscaleR для стандартных статистических методов понижения разрешения
pyClim-SDM (ahernanzl/pyClim-SDM)
Этот репозиторий предлагает статистическое понижение разрешения для прогнозов изменения климата с графическим пользовательским интерфейсом [источник], предоставляя:
- Удобный интерфейс для рабочих процессов понижения разрешения
- Поддержку прогнозов изменения климата (релевантно для приложений в области палеоклимата)
- Реализацию на основе Python с доступностью через графический интерфейс
Шаги реализации
На основе доступных репозиториев, вот общий рабочий процесс для понижения разрешения данных палеоклимата MPI-ESM1-2-LR:
1. Получение данных
- Получите данные MPI-ESM1-2-LR из ESGF через портал CMIP6
- Используйте синтаксис ссылки на данные:
CMIP6.PMIP.MPI-M.MPI-ESM1-2-LR[источник] - Скачайте необходимые переменные (предикторы) в виде файлов netCDF
- Подготовьте наблюдаемые данные или выходные данные модели с высоким разрешением в качестве предиктандов (обычно в формате CSV)
2. Предварительная обработка
- Используйте xarray или аналогичные библиотеки Python для обработки данных netCDF
- Согласуйте временные и пространственные домены между предикторами и предиктандами
- Применяйте контроль качества и коррекцию смещения при необходимости
3. Обучение модели
- Выберите подходящий метод понижения разрешения (статистический или на основе глубокого обучения)
- Для PyESD: Используйте модель PP-ESD с передаточными функциями машинного обучения
- Для DeepDownscaling: Применяйте подходы на основе глубокого обучения, подходящие для ваших конкретных переменных
4. Применение понижения разрешения
- Примените обученную модель к симуляциям палеоклимата MPI-ESM1-2-LR
- Интерполируйте результаты до вашего целевого разрешения 10-50 км
- Проверьте результаты с использованием независимых данных или методов перекрестной проверки
5. Постобработка
- Проанализируйте эффективность и неопределенность понижения разрешения
- Создайте визуализации и статистические сводки
- Подготовьте данные для дальнейшего анализа или публикации
Доступ к данным из ESGF
Получение данных MPI-ESM1-2-LR из Федерации сетей данных Земной системы (ESGF) включает несколько ключевых шагов:
Доступ к порталу данных
- Данные доступны через портал Всемирного центра данных по климату (WDC) [источник]
- Используйте поисковый портал ESGF для поиска конкретных наборов данных MPI-ESM1-2-LR
- Выходные данные модели подготовлены для деятельности PMIP CMIP6 [источник]
Структура данных
- MPI-ESM1-2-LR использует атмосферное разрешение T63 (~сетка 200 км)
- Данные следуют соглашениям синтаксиса ссылки на данные CMIP6
- Доступно множество переменных и периодов времени для приложений в области палеоклимата
Рекомендации по скачиванию
- Большие размеры файлов, типичные для данных климатических моделей
- Требуются соответствующие ресурсы для хранения и вычислений
- Рассмотрите возможность использования инструментов передачи данных ESGF для эффективного скачивания
Заключение
Несколько комплексных рабочих процессов на Python доступны для понижения разрешения данных палеоклимата MPI-ESM1-2-LR до вашего целевого разрешения 10-50 км. Пакет PyESD, кажется, наиболее релевантен, предлагая возможности эмпирическо-статистического понижения разрешения, специально разработанные для климатических переменных. Для тех, кто интересуется подходами на основе глубокого обучения, репозитории, такие как DeepDownscaling и scikit-downscale, предоставляют мощные альтернативы.
Ключевые рекомендации:
- Начните с PyESD благодаря его целевому подходу к эмпирическо-статистическому понижению разрешения
- Рассмотрите методы глубокого обучения, если у вас достаточные вычислительные ресурсы и обучающие данные
- Обеспечьте правильную предварительную обработку данных и валидацию для сохранения целостности сигнала палеоклимата
- Используйте существующие ресурсы рабочих групп PMIP для поддержки сообщества и лучших практик
Область понижения разрешения палеоклимата продолжает быстро развиваться, поэтому взаимодействие с соответствующими репозиториями GitHub и рабочими группами PMIP поможет вам получить доступ к последним разработкам и поддержке сообщества.
Источники
- PyESD - Python Package for Empirical Statistical Downscaling
- GMD - pyESDv1.0.1: an open-source Python framework for empirical-statistical downscaling of climate information
- pyClim-SDM - Statistical Downscaling for Climate Change Projections with a Graphical User Interface
- DeepDownscaling - Deep learning approaches for statistical downscaling in climate
- scikit-downscale - Statistical climate downscaling in Python
- project-cchain-climate-downscaling - Open deep-learning based climate downscaling model for data poor areas
- CMIP6 Citation - MPI-M MPI-ESM1.2-LR model output prepared for CMIP6 PMIP
- Max Planck Institute Earth System Model (MPI-ESM1.2) for the High-Resolution Model Intercomparison Project
- Developments in the MPI‐M Earth System Model version 1.2 (MPI‐ESM1.2) and Its Response to Increasing CO2
- MPI-ESM1.2-LR P2k+ with a deep version of JSBACH